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NCBI:生物医学文献、基因组/蛋白序列、蛋白结构、芯片测序数据等。
Ensembl:基因组浏览器,可用于查询基因组/蛋白序列、比较基因组、序列变异、转录调控等。
UCSC genome browser: 基因组浏览器,可用于获取基因组序列、基因组注释、序列比对、各类注释元件可视化等。
UniProt: 蛋白质序列及功能注释,可获取蛋白质结构域注释等。
表观组资源
ENCODE: 模式细胞系和部分组织的各类表观组测序
WashU genome browser: ENCODE数据的可视化
Cistrome: 其中的CistromeDB收录了各类公共ChIP-seq数据
4DN: 含各类染色质结构相关数据,支持HiGlass可视化
epilogos: 表观注释的可视化工具
descartes: 含各模式物种的scATAC数据
肿瘤基因组资源
ICGC: 肿瘤基因组、转录组资源
xena browser: 含TCGA及肿瘤细胞系相关基因组、转录组等资源
HTAN: NCI资助的肿瘤登月计划,致力于建立肿瘤发生过程中动态的细胞、形态、分子特征,含各癌型的单细胞测序数据